基因大数据可以投资吗?
这个概念其实有点宽泛,我直接给你具体例子吧。 比如你问的TCGA(胃癌)数据,其实它是个基因芯片的数据,已经做了测序了,所以实际上你可以直接拿测序的结果进行生物信息学的分析。 但同时,很多公司都提供了基于外采的基因检测服务,它们通过高通量的方法来检测你的基因组,发现你的基因突变情况(也就是遗传信息和DNA水平的信息)。 如果你希望了解自己的整个家族史,想知道家族里哪些人是癌,哪些人的基因突变情况如何,哪类人得癌的风险高一些,那么最好结合你家遗传性肿瘤的风险因素(比如是否有BRCA1/2基因突变的家族女性成员,是否是有乳腺癌、卵巢癌等遗传倾向的家族)一起考虑。
这时你需要做两个事情:
① 从基因组层面,需要知道家族的遗传变异情况,即每个人基因组的序列是什么;
② 从表型层面,需要收集所有家庭成员的肿瘤发生情况,包括时间、部位、类型等等。 然后我们把这些东西放在一个数据库里面进行分析,就可以得出每一个家族成员的个体风险得分情况。 这个工作可以通过生物信息学来完成,但是目前绝大多数的生物信息学分析都是基于公开的数据库进行的,真正自己做大数据的分析非常少。
另外一点,现在有许多的公司的药物研发是通过小分子化合物来刺激或者抑制特定的基因信号通路而达到治疗的目的。这些药物可能针对某一类疾病,也可能针对某一类患者群体(比如针对亚裔人群)。 如果想要了解这类药物的有效性和安全性,就需要建立一个包含有大量临床数据的数据库,然后通过对药物诱发基因突变的可能性,以及基因突变导致药物敏感性的分析,预测患者的用药效果和不良反应。 目前我正在从事这方面的工作,希望能找到有兴趣合作的小伙伴~